HPCC cluster Benchmark
La présentation est une traduction du site web hpcc.
Le Benchmark HPCC (http://icl.cs.utk.edu/hpcc) est constitué de sept tests
- HPL – Le benchmark linpack TPP qui mesure la rapidité d’exécution en virgule flottante pour la résolution d’une système d’équations linéaires.
- DGEMM – mesure la rapidité d’exécution en virgule flottante pour le produit de matrices en double précision.
- STREAM – un simple benchmark qui mesure la bande passante de la mémoire (en GB/s) et un autre truc lié au kernel (??? avis aux traducteurs avisés).
- PTRANS (Transposition de matrice en Parralèlle) – met sous contrainte les communications entre processeurs pour le calcul parallèle. Ce test est pratique pour connaître la capacité totale du réseau du point de vue des échanges de données.
- RandomAccess – mesure la vitesse de mise à jour de la mémoire par un test mettant en jeu des entiers aléatoires.
- FFT – mesure la rapidité d’exéction en double précision à virgule flottante en complexe pour une transformation de Fourrier complexe.
- Communication bandwidth and latency – un panel de tests pour mesurer la latence et la bande passante pour un nombre de communications simultanées, basé sur b_eff (effective bandwidth benchmark).
Mise en oeuvre du Benchmark:
wget http://icl.cs.utk.edu/projectsfiles/hpcc/download/hpcc-1.4.1.tar.gz tar -xvzf hpcc-1.4.1.tar.gz cd hpcc-1.4.1
Il fut installer les paquets nécessaires au fonctionnement du Benchmark:
pacman -S yaourt #Si pas déjà fait yaourt -S openmpi yaourt -S mpich2 yaourt -S atlas-lapack
Là il faut installer un Makefile dans le répertoire hpl. Des fichiers exemple sont données dans hpl/setup.
Ci-joint celui que j’ai pour exemple (marche sur Archlinux). Je l’ai appelé Make.Linux.
# ----------------------------------------------------------------------
# - shell --------------------------------------------------------------
# ----------------------------------------------------------------------
#
SHELL = /bin/sh
#
CD = cd
CP = cp
LN_S = ln -s
MKDIR = mkdir
RM = /bin/rm -f
TOUCH = touch
#
# ----------------------------------------------------------------------
# - Platform identifier ------------------------------------------------
# ----------------------------------------------------------------------
#
ARCH = $(arch)
#
# ----------------------------------------------------------------------
# - HPL Directory Structure / HPL library ------------------------------
# ----------------------------------------------------------------------
#
TOPdir = ../../..
INCdir = $(TOPdir)/include
BINdir = $(TOPdir)/bin/$(ARCH)
LIBdir = $(TOPdir)/lib/$(ARCH)
#
HPLlib = $(LIBdir)/libhpl.a
#
# ----------------------------------------------------------------------
# - Message Passing library (MPI) --------------------------------------
# ----------------------------------------------------------------------
# MPinc tells the C compiler where to find the Message Passing library
# header files, MPlib is defined to be the name of the library to be
# used. The variable MPdir is only used for defining MPinc and MPlib.
#
MPdir = /opt/mpich2/
MPinc = -I$(MPdir)/include
MPlib = $(MPdir)/lib/libmpich.a
#
# ----------------------------------------------------------------------
# - Linear Algebra library (BLAS or VSIPL) -----------------------------
# ----------------------------------------------------------------------
# LAinc tells the C compiler where to find the Linear Algebra library
# header files, LAlib is defined to be the name of the library to be
# used. The variable LAdir is only used for defining LAinc and LAlib.
#
LAdir = /usr/lib
LAinc =
LAlib = $(LAdir)/libf77blas.a $(LAdir)/libatlas.a
#
# ----------------------------------------------------------------------
# - F77 / C interface --------------------------------------------------
# ----------------------------------------------------------------------
# You can skip this section if and only if you are not planning to use
# a BLAS library featuring a Fortran 77 interface. Otherwise, it is
# necessary to fill out the F2CDEFS variable with the appropriate
# options. **One and only one** option should be chosen in **each** of
# the 3 following categories:
#
# 1) name space (How C calls a Fortran 77 routine)
#
# -DAdd_ : all lower case and a suffixed underscore (Suns,
# Intel, ...), [default]
# -DNoChange : all lower case (IBM RS6000),
# -DUpCase : all upper case (Cray),
# -DAdd__ : the FORTRAN compiler in use is f2c.
#
# 2) C and Fortran 77 integer mapping
#
# -DF77_INTEGER=int : Fortran 77 INTEGER is a C int, [default]
# -DF77_INTEGER=long : Fortran 77 INTEGER is a C long,
# -DF77_INTEGER=short : Fortran 77 INTEGER is a C short.
#
# 3) Fortran 77 string handling
#
# -DStringSunStyle : The string address is passed at the string loca-
# tion on the stack, and the string length is then
# passed as an F77_INTEGER after all explicit
# stack arguments, [default]
# -DStringStructPtr : The address of a structure is passed by a
# Fortran 77 string, and the structure is of the
# form: struct {char *cp; F77_INTEGER len;},
# -DStringStructVal : A structure is passed by value for each Fortran
# 77 string, and the structure is of the form:
# struct {char *cp; F77_INTEGER len;},
# -DStringCrayStyle : Special option for Cray machines, which uses
# Cray fcd (fortran character descriptor) for
# interoperation.
#
F2CDEFS = -DAdd_ -DF77_INTEGER=int -DStringSunStyle
#
# ----------------------------------------------------------------------
# - HPL includes / libraries / specifics -------------------------------
# ----------------------------------------------------------------------
#
HPL_INCLUDES = -I$(INCdir) -I$(INCdir)/$(ARCH) $(LAinc) $(MPinc)
HPL_LIBS = $(HPLlib) $(LAlib) $(MPlib) -lm
#
# - Compile time options -----------------------------------------------
#
# -DHPL_COPY_L force the copy of the panel L before bcast;
# -DHPL_CALL_CBLAS call the cblas interface;
# -DHPL_CALL_VSIPL call the vsip library;
# -DHPL_DETAILED_TIMING enable detailed timers;
#
# By default HPL will:
# *) not copy L before broadcast,
# *) call the BLAS Fortran 77 interface,
# *) not display detailed timing information.
#
HPL_OPTS =
#
# ----------------------------------------------------------------------
#
HPL_DEFS = $(F2CDEFS) $(HPL_OPTS) $(HPL_INCLUDES)
#
# ----------------------------------------------------------------------
# - Compilers / linkers - Optimization flags ---------------------------
# ----------------------------------------------------------------------
#
CC = mpicc
CCNOOPT = $(HPL_DEFS)
CCFLAGS = $(HPL_DEFS) -fomit-frame-pointer -O3 -funroll-loops -W -Wall
#
# On some platforms, it is necessary to use the Fortran linker to find
# the Fortran internals used in the BLAS library.
#
LINKER = mpif77
LINKFLAGS = $(CCFLAGS)
#
ARCHIVER = ar
ARFLAGS = r
RANLIB = echo
#
# ----------------------------------------------------------------------
Ensuite , il faut compiler :
make all arch=Linux
Arch est égal à Linux car le makefile s’appelle Make.Linux.
Il faut ensuite lancer le programme:
mv _hpccinf.txt hpccinf.txt # l'Editer pour ajuster les paramètres mpirun -np 4 hpcc
Bilan: SpareBabasse fait 2.69 Gflops au test hpl avec -np 1 et 2.41 + 2.39 avec -np 2
Pas si mal pour elle!
Edit: Si vous avez effectués des tests, n’hésitez pas à mettre les résultats en commentaires avec une description de vos machines.
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